Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RTN1Q16799 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RTN1Q16799 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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