Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FSCN1Q16658 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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