Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ZNF239Q16600 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ZNF239Q16600 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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