Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
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FXNQ16595 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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FXNQ16595 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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FXNQ16595 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FXNQ16595 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FXNQ16595 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FXNQ16595 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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FXNQ16595 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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FXNQ16595 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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FXNQ16595 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FXNQ16595 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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