Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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