Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms