Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKIV2LQ15477 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms