Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNB1Q14721 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms