Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNGB1Q14028 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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