Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHROOM2Q13796 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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SHROOM2Q13796 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHROOM2Q13796 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
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