Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMAD4Q13485 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms