Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PMS2P3Q13401 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PMS2P3Q13401 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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