Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SP140Q13342 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SP140Q13342 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SP140Q13342 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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