Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRSF5Q13243 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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