Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CBX3Q13185 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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