Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPA4Q13156 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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