Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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MRPL28Q13084 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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MRPL28Q13084 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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