Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TRAF2Q12933 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAF2Q12933 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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