Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms