Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA3Q08378 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA3Q08378 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms