Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITIH3Q06033 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms