Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TNFRSF17Q02223 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms