Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SPTBN1Q01082 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SPTBN1Q01082 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms