Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IRF9Q00978 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms