Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ERVFRD-1P60508 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms