Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PGGT1BP53609 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms