Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VEGFBP49765 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms