Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP4P49662 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP4P49662 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASP4P49662 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms