Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRIM2P49643 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms