Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms