Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GNPDA1P46926 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms