Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XCR1P46094 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms