Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms