Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms