Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC1P35052 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC1P35052 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC1P35052 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC1P35052 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC1P35052 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC1P35052 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms