Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CPS1P31327 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPS1P31327 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms