Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCAP28676 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCAP28676 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms