Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX2P28328 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms