Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NFKBIAP25963 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms