Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPREP23469 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPREP23469 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPREP23469 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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