Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRPS1L1P21108 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms