Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CXCL2P19875 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CXCL2P19875 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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