Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTPS1P17812 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTPS1P17812 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms