Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK4P11802 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK4P11802 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms