Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR2F1P10589 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR2F1P10589 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms