Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CBSLP0DN79 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms