Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBP07199 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPBP07199 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBP07199 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBP07199 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBP07199 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBP07199 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms