Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HLA-DQB1P01920 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HLA-DQB1P01920 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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