Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIOO75962 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIOO75962 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIOO75962 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIOO75962 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIOO75962 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIOO75962 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIOO75962 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIOO75962 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms