Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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HOXA3O43365 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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